/usr/bin/c++  -Wno-deprecated-enum-enum-conversion -Wno-deprecated-declarations -Wno-unused-result -O3 -fopenmp -O3 -DNDEBUG CMakeFiles/nvBowtie.dir/nvBowtie.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/quality_coeffs.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/aligner_all_ed.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/aligner_all_sw.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/aligner_best_approx_ed.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/aligner_best_approx_wfa.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/aligner_best_approx_paired_ed.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/aligner_best_approx_paired_sw.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/aligner_best_approx_paired_wfa.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/aligner_best_approx_sw.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/aligner_init.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/aligner_sort.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/compute_thread.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/checksums.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/input_thread.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/output_thread.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/mapping.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/mapq.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/params.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/persist.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/reduce.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/score_all.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/score_best.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/score_gapped.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/score_ungapped.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/score_paired.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/scoring_queues_test.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/select.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/seed_hit_deque_array.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/seed_hit_deque_array_test.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/stats.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/bowtie2/cuda/traceback.cu.o CMakeFiles/nvBowtie.dir/cmake_device_link.o -o nvBowtie   -L/usr/lib/x86_64-linux-gnu/stubs  -L/usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/12  ../nvbio/libnvbio.a ../contrib/zlib-1.2.7/libz.a ../contrib/lz4/liblz4.a ../contrib/crc/libcrcstatic.a -lrt /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcuda.so /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcudart.so /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/13/libgomp.so /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.a -lcudadevrt -lcudart_static -lrt -lpthread -ldl 
