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## Hisat2-Single_Read.yml ##
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idx_basedir:
  class: Directory
  path: ./data

idx_basename: tair10.fasta

fq1:
  class: File
  path: _FASTQ_PATH1_
  
SampleName: _SampleName_

results_path:
  class: Directory
  path: ./results

thread: 4

ModulesToLoad: 
  module1: hisat2/2.1.0

